甲亢是一种顽固性、难治性内分泌疾病，长期不进行甲亢治疗或治疗效果不好或反复复发，最终会导致全身多系统严重损害。
1.影响社交
由于患者心烦易怒，声高气粗，常表现为爱发脾气，极易与人吵架，极大影响与家人及他人的关系。
2.影响劳动及工作效率
甲亢患者，心冲气促，失眠多梦，劳动及工作效率低下，甚至丧失劳动能力。造成突眼、眼皮闭不紧或两眼复视等眼睛的病变，严重者最后还会失明。
3.引发糖尿病
甲亢患者，心冲气促，失眠多梦，劳动及工作效率低下，甚至丧失劳动能力。造成突眼、眼皮闭不紧或两眼复视等眼睛的病变，严重者最后还会失明。
4.引发心血管病
因为心肌细胞上T3受体较多，所以心血管系统对过量甲状腺激素的反应较强，导致心肌耗氧量增加，心脏的负担加重。甲状腺激素长期作用心脏，容易导致心脏变得肥大，出现心房纤颤，心律失常甚至心力衰竭而死亡。
5.引发肝病
甲亢引起肝脏损害的原因是：甲亢时氧消耗增多，致使肝脏相对供氧不足；甲亢时分解代谢明显增加，造成肝糖原耗损增加，各种营养物质如氨基酸，维生素消耗过多；甲亢患者由于心力衰竭致使肝静脉瘀血及肝小叶中央坏死；并发感染和休克。
6.引发肾小管性酸中*
*性弥漫性甲状腺肿是一种自身免疫性疾病，其自身免疫病变部位不仅限于甲状腺，也同时发生在肾小管。肾小管的病变导致肾小管酸化尿液的功能障碍，即酸性物质不能由肾小管分泌出来随尿液排泄，因此积蓄在血液中而导致酸中*。
7.对生育及性功能的影响
女性甲亢患者，不少人月经失调，甚至停经，性欲低下，不孕娠，男性甲亢患者易致性欲减退，阳痿、早泄，造成不育。
8.运动系统损害
甲亢的肌肉症状多数表现为轻度的肌软弱到重度的肌无力和肌萎缩，可伴有细微震颤、腱反射活跃和反射时间缩短。
9.引发其他疾病
甲亢控制不好的患者，蛋白质和钙磷代谢负平衡，将发生骨质稀疏。患者主诉骨痛、腰痛，腰椎拍片为压缩性骨折，摔跤跌倒后容易发生骨折。长期甲亢控制不好的患者，全身各个脏器受到影响，功能衰竭，全身营养不良，很容易发生感染。在外因(感染，劳累，各种应激)作用下，会发生甲亢危象，表现为高热，腹泻，谵妄甚至昏迷，合并心衰、休克和*疸者，预后不佳，死亡率较高。